MYDOGDNA -testaus
MyDogDNA-testauspalvelun avulla koiranomistaja saa tietoa siitä, mitä koiralla on perimässään. Testi sisältää perimänlaajuisen analyysin, johon sisältyy tietoa ja tuloksia lukuisista periytyvistä ominaisuuksista ja sairauksista. Testi mittaa satoja perinnöllisiä sairauksia, ulkomuoto-ominaisuuksia (turkin väri ja laatu, kuonon pituus, pystykorvaisuus jne.) sekä mittaa perimän monimuotoisuuden. Tässä kerron hieman tuloksista kääpiöpinserien ja omien koirieni osalta. Tekstissä on vapaamuotoisia lainauksia MyDogDNA -palvelun verkkosivuilta mydogdna.com/fi ja tämän sivun kuvat on muokattu palvelun kuvaajien pohjalta.
Perimän monimuotoisuus
Monimuotoisuus mitataan niiden perimän kohtien perusteella, joissa koira on heterotsygootti eli se on perinyt erilaisen alleelin sekä isän että emän puolelta. Kuvaaja näyttää koiran perimän monimuotoisuuden suhteessa rotuun, roturyhmään sekä muihin tietokannan koiriin. Kuvan 1 sininen kuvaaja kertoo testattujen kääpiöpinserien monimuotoisuustilanteen. Kääpiöpinserien mediaani on 32,9%: onkin mukava huomata, että omat testatut koirat sijoittuvat reilusti monimuotoisempaan päähän kuvaajaa.
Perimän monimuotoisuus
Monimuotoisuus mitataan niiden perimän kohtien perusteella, joissa koira on heterotsygootti eli se on perinyt erilaisen alleelin sekä isän että emän puolelta. Kuvaaja näyttää koiran perimän monimuotoisuuden suhteessa rotuun, roturyhmään sekä muihin tietokannan koiriin. Kuvan 1 sininen kuvaaja kertoo testattujen kääpiöpinserien monimuotoisuustilanteen. Kääpiöpinserien mediaani on 32,9%: onkin mukava huomata, että omat testatut koirat sijoittuvat reilusti monimuotoisempaan päähän kuvaajaa.
Perinnölliset eroavaisuudet
Kuvassa 2 jokainen testattu MyDogDNA-tietokannan kääpiöpinseri näkyy yhtenä pallona. Koirien etäisyydet toisistaan kuvaavat yksilöiden perimien erilaisuutta: jos koirat ovat kuvaajalla lähekkäin, niiden perimä on keskenään hyvin samankaltainen. Kun testattujen koirien lukumäärä kasvaa, kuvaajasta on mahdollista päätellä rodun sisälle syntyneitä eriperimäisiä linjoja: jo nykyisellään muutaman kymmenen testatun kääpiöpinserin perusteella voi sanoa, että maantieteelliset erot ovat suuria. Kuvassa 2 suomalaiset koirat on merkitty lyhenteellä FI, amerikkalaiset koirat US ja englantilaiset UK. Koirat ryhmittyvät selkeästi erilleen. Tästä kuvaajasta ei voi päätellä sitä, minkä maan(osan) koirat ovat perimältään monimuotoisimpia, tämä esittää vain yksilöiden välisiä eroja. Ikävä kyllä tietokannassa ei ole tällä hetkellä julkisia tuloksia näistä ulkomaisista tutkituista kääpiöpinsereistä.
Kuvassa 2 jokainen testattu MyDogDNA-tietokannan kääpiöpinseri näkyy yhtenä pallona. Koirien etäisyydet toisistaan kuvaavat yksilöiden perimien erilaisuutta: jos koirat ovat kuvaajalla lähekkäin, niiden perimä on keskenään hyvin samankaltainen. Kun testattujen koirien lukumäärä kasvaa, kuvaajasta on mahdollista päätellä rodun sisälle syntyneitä eriperimäisiä linjoja: jo nykyisellään muutaman kymmenen testatun kääpiöpinserin perusteella voi sanoa, että maantieteelliset erot ovat suuria. Kuvassa 2 suomalaiset koirat on merkitty lyhenteellä FI, amerikkalaiset koirat US ja englantilaiset UK. Koirat ryhmittyvät selkeästi erilleen. Tästä kuvaajasta ei voi päätellä sitä, minkä maan(osan) koirat ovat perimältään monimuotoisimpia, tämä esittää vain yksilöiden välisiä eroja. Ikävä kyllä tietokannassa ei ole tällä hetkellä julkisia tuloksia näistä ulkomaisista tutkituista kääpiöpinsereistä.
Perimän terveysindeksi (Genetic Health Index = GHI)
Perimän terveysindeksi kuvaa koiran perimän terveyttä testattujen perinnöllisten sairauksien ja perimän monimuotoisuuden pohjalta. Keskiverron koiran indeksi on 100, ja indeksin arvo on sitä suurempi, mitä geneettisesti terveempi koira on. Perinnölliset sairaudet ja samaperimäisyys laskevat indeksiä. Indeksi ei huomioi niitä rodulla tunnettuja sairauksia, joille ei ole vielä DNA-testiä tai testi ei ole mukana paneelissa. Koiran GHI-arvo ei ole vakio, vaan se muuttuu testattujen koirien määrän kasvaessa. Suuri GHI ei tarkoita, että näiden koirien jälkeläisistä tulisi automaattisesti terveempiä: koirien täytyy myös olla riittävän eriperimäisiä. MyDogDNA -palvelun kasvattajatyökalulla (Breeder Tool) voi laskea keskimääräisen indeksin yhdistelmälle.
Perimän terveysindeksi kuvaa koiran perimän terveyttä testattujen perinnöllisten sairauksien ja perimän monimuotoisuuden pohjalta. Keskiverron koiran indeksi on 100, ja indeksin arvo on sitä suurempi, mitä geneettisesti terveempi koira on. Perinnölliset sairaudet ja samaperimäisyys laskevat indeksiä. Indeksi ei huomioi niitä rodulla tunnettuja sairauksia, joille ei ole vielä DNA-testiä tai testi ei ole mukana paneelissa. Koiran GHI-arvo ei ole vakio, vaan se muuttuu testattujen koirien määrän kasvaessa. Suuri GHI ei tarkoita, että näiden koirien jälkeläisistä tulisi automaattisesti terveempiä: koirien täytyy myös olla riittävän eriperimäisiä. MyDogDNA -palvelun kasvattajatyökalulla (Breeder Tool) voi laskea keskimääräisen indeksin yhdistelmälle.
Omat testatut koirat
Olen testauttanut useita kääpiöpinsereitä. Alla koirien tämänhetkiset GHI-arvot:
Jevil's Kiss Keeper: 113
Schelmenstreich Ninya: 115
Bytekeeper Zathura: 117
Bonzer's Catepillar: 107
Blue-Star Tarkan: 112
Bytekeeper Yakuza: 107
Bytekeeper Yoshi: 111
Tavoitteena minulla on tietenkin lisätä ja/tai ylläpitää monimuotoisuutta. Kasvattajatyökalu antoi Bambin vanhempien yhdistelmälle GHI-arvion 109, joka ylittyi hienosti, kun Bambin GHI oli lopulta 117: se on korkeampi kuin kummallakaan vanhemmista. Yhdistelmä siis lisäsi tämän testin perusteella geneettistä monimuotoisuutta.
Testattujen sairauksien osalta kaikki koirat olivat terveitä, eli ei löydöksiä. Sairauksista tärkein on kääpiöpinsereiltä alun perin löydetty kystinurian mutaatio tyyppi II-B. Lisäksi kääpiöpinsereitä koskettaa testipaneelissa myös kaikille roduille yhteiset lääkeaineyliherkkyydet MDR1-mutaatio ja maligni hypertermia.